Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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SEC23BQ15437 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SEC23BQ15437 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SEC23BQ15437 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SEC23BQ15437 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SEC23BQ15437 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SEC23BQ15437 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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SEC23BQ15437 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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SEC23BQ15437 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SEC23BQ15437 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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