Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PSMD6Q15008 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMD6Q15008 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms