Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
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SHROOM2Q13796 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
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SHROOM2Q13796 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHROOM2Q13796 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHROOM2Q13796 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
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