Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
APOFQ13790 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
APOFQ13790 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOFQ13790 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOFQ13790 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOFQ13790 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOFQ13790 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOFQ13790 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOFQ13790 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOFQ13790 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOFQ13790 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOFQ13790 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOFQ13790 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOFQ13790 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOFQ13790 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOFQ13790 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOFQ13790 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOFQ13790 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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APOFQ13790 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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APOFQ13790 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOFQ13790 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOFQ13790 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOFQ13790 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APOFQ13790 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOFQ13790 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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APOFQ13790 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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APOFQ13790 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOFQ13790 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOFQ13790 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOFQ13790 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOFQ13790 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOFQ13790 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOFQ13790 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOFQ13790 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
APOFQ13790 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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