Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
FHL3Q13643 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FHL3Q13643 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms