Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC19■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC19■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF5Q13568 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms