Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP1Q13363 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP1Q13363 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP1Q13363 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTBP1Q13363 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTBP1Q13363 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTBP1Q13363 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTBP1Q13363 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTBP1Q13363 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTBP1Q13363 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTBP1Q13363 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTBP1Q13363 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTBP1Q13363 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTBP1Q13363 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTBP1Q13363 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CTBP1Q13363 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTBP1Q13363 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTBP1Q13363 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms