Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SGCGQ13326 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms