Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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TRAF1Q13077 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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TRAF1Q13077 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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TRAF1Q13077 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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TRAF1Q13077 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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TRAF1Q13077 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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TRAF1Q13077 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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TRAF1Q13077 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAF1Q13077 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
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