Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

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Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM32Q13049 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRIM32Q13049 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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