Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP3Q12983 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms