Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EFEMP1Q12805 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EFEMP1Q12805 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
EFEMP1Q12805 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFEMP1Q12805 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFEMP1Q12805 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EFEMP1Q12805 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFEMP1Q12805 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFEMP1Q12805 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFEMP1Q12805 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFEMP1Q12805 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFEMP1Q12805 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFEMP1Q12805 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFEMP1Q12805 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFEMP1Q12805 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFEMP1Q12805 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFEMP1Q12805 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EFEMP1Q12805 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFEMP1Q12805 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFEMP1Q12805 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFEMP1Q12805 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFEMP1Q12805 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFEMP1Q12805 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EFEMP1Q12805 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EFEMP1Q12805 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFEMP1Q12805 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EFEMP1Q12805 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EFEMP1Q12805 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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