Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNA1Q09470 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms