Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PUDPQ08623 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms