Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABPB1Q06547 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms