Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MC1RQ01726 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MC1RQ01726 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms