Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms