Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK17Q00537 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms