Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CDK6Q00534 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms