Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms