Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRB1P82279 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRB1P82279 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRB1P82279 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRB1P82279 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRB1P82279 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRB1P82279 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CRB1P82279 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRB1P82279 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRB1P82279 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRB1P82279 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRB1P82279 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRB1P82279 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRB1P82279 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CRB1P82279 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CRB1P82279 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRB1P82279 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRB1P82279 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRB1P82279 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CRB1P82279 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRB1P82279 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRB1P82279 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRB1P82279 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRB1P82279 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRB1P82279 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRB1P82279 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRB1P82279 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRB1P82279 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRB1P82279 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRB1P82279 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRB1P82279 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRB1P82279 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRB1P82279 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRB1P82279 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRB1P82279 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRB1P82279 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRB1P82279 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CRB1P82279 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB1P82279 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB1P82279 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB1P82279 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB1P82279 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB1P82279 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB1P82279 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB1P82279 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB1P82279 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB1P82279 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB1P82279 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB1P82279 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB1P82279 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB1P82279 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB1P82279 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB1P82279 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB1P82279 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB1P82279 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB1P82279 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB1P82279 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB1P82279 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB1P82279 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB1P82279 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB1P82279 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB1P82279 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB1P82279 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRB1P82279 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB1P82279 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB1P82279 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB1P82279 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB1P82279 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB1P82279 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB1P82279 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB1P82279 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB1P82279 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB1P82279 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB1P82279 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB1P82279 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB1P82279 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB1P82279 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB1P82279 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB1P82279 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB1P82279 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB1P82279 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB1P82279 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB1P82279 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB1P82279 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB1P82279 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB1P82279 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB1P82279 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRB1P82279 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB1P82279 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB1P82279 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB1P82279 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB1P82279 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB1P82279 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB1P82279 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB1P82279 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB1P82279 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB1P82279 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB1P82279 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB1P82279 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRB1P82279 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms