Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FBXW4P57775 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FBXW4P57775 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms