Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DAP3P51398 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DAP3P51398 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DAP3P51398 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DAP3P51398 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DAP3P51398 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DAP3P51398 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DAP3P51398 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DAP3P51398 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DAP3P51398 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DAP3P51398 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DAP3P51398 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DAP3P51398 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DAP3P51398 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DAP3P51398 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DAP3P51398 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DAP3P51398 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DAP3P51398 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DAP3P51398 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DAP3P51398 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DAP3P51398 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DAP3P51398 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DAP3P51398 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DAP3P51398 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DAP3P51398 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DAP3P51398 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DAP3P51398 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DAP3P51398 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DAP3P51398 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms