Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERFP50548 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERFP50548 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERFP50548 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERFP50548 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERFP50548 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ERFP50548 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERFP50548 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERFP50548 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms