Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCAMP43121 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCAMP43121 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCAMP43121 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCAMP43121 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCAMP43121 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCAMP43121 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCAMP43121 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCAMP43121 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCAMP43121 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCAMP43121 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCAMP43121 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCAMP43121 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCAMP43121 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCAMP43121 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCAMP43121 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCAMP43121 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCAMP43121 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCAMP43121 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCAMP43121 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCAMP43121 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCAMP43121 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCAMP43121 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCAMP43121 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCAMP43121 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCAMP43121 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCAMP43121 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MCAMP43121 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MCAMP43121 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCAMP43121 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCAMP43121 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCAMP43121 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCAMP43121 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCAMP43121 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCAMP43121 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MCAMP43121 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCAMP43121 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCAMP43121 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCAMP43121 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MCAMP43121 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCAMP43121 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCAMP43121 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCAMP43121 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCAMP43121 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCAMP43121 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCAMP43121 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MCAMP43121 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCAMP43121 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCAMP43121 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCAMP43121 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCAMP43121 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCAMP43121 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCAMP43121 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCAMP43121 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCAMP43121 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCAMP43121 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms