Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC1A1P43005 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms