Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIA2P42262 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIA2P42262 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms