Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIM23P36406 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms