Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA3P32297 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA3P32297 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms