Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ITGA4P13612 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms