Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFTRP13569 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFTRP13569 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFTRP13569 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CFTRP13569 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CFTRP13569 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CFTRP13569 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CFTRP13569 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CFTRP13569 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CFTRP13569 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CFTRP13569 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFTRP13569 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFTRP13569 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFTRP13569 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFTRP13569 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFTRP13569 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CFTRP13569 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFTRP13569 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CFTRP13569 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFTRP13569 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CFTRP13569 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFTRP13569 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFTRP13569 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFTRP13569 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFTRP13569 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFTRP13569 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFTRP13569 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFTRP13569 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CFTRP13569 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFTRP13569 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFTRP13569 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFTRP13569 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFTRP13569 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CFTRP13569 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFTRP13569 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFTRP13569 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFTRP13569 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFTRP13569 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFTRP13569 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFTRP13569 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFTRP13569 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CFTRP13569 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFTRP13569 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFTRP13569 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFTRP13569 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFTRP13569 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFTRP13569 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFTRP13569 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFTRP13569 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFTRP13569 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFTRP13569 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFTRP13569 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CFTRP13569 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFTRP13569 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFTRP13569 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFTRP13569 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFTRP13569 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFTRP13569 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFTRP13569 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFTRP13569 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFTRP13569 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFTRP13569 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CFTRP13569 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFTRP13569 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFTRP13569 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFTRP13569 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFTRP13569 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFTRP13569 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFTRP13569 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFTRP13569 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFTRP13569 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFTRP13569 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CFTRP13569 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFTRP13569 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFTRP13569 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFTRP13569 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFTRP13569 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFTRP13569 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CFTRP13569 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFTRP13569 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFTRP13569 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFTRP13569 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFTRP13569 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFTRP13569 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFTRP13569 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFTRP13569 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFTRP13569 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFTRP13569 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFTRP13569 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFTRP13569 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFTRP13569 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFTRP13569 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFTRP13569 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFTRP13569 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFTRP13569 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFTRP13569 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFTRP13569 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFTRP13569 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CFTRP13569 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CFTRP13569 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms