Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCL2P13500 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCL2P13500 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL2P13500 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL2P13500 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL2P13500 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL2P13500 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL2P13500 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL2P13500 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL2P13500 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL2P13500 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL2P13500 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL2P13500 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL2P13500 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL2P13500 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL2P13500 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL2P13500 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL2P13500 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL2P13500 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL2P13500 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL2P13500 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL2P13500 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL2P13500 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL2P13500 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL2P13500 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL2P13500 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL2P13500 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL2P13500 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL2P13500 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL2P13500 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL2P13500 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL2P13500 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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