Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TPRP12270 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TPRP12270 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TPRP12270 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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