Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
VPREB1P12018 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms