Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODC1P11926 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODC1P11926 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ODC1P11926 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ODC1P11926 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ODC1P11926 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms