Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL3P10147 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL3P10147 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL3P10147 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms