Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI3P10071 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI3P10071 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI3P10071 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI3P10071 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI3P10071 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI3P10071 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI3P10071 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI3P10071 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI3P10071 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI3P10071 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI3P10071 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI3P10071 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI3P10071 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI3P10071 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI3P10071 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GLI3P10071 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI3P10071 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI3P10071 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI3P10071 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI3P10071 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI3P10071 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI3P10071 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI3P10071 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI3P10071 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI3P10071 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI3P10071 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI3P10071 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI3P10071 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI3P10071 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI3P10071 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI3P10071 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI3P10071 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI3P10071 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI3P10071 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI3P10071 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI3P10071 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI3P10071 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI3P10071 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI3P10071 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI3P10071 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI3P10071 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI3P10071 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GLI3P10071 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GLI3P10071 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI3P10071 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI3P10071 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI3P10071 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI3P10071 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI3P10071 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI3P10071 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI3P10071 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI3P10071 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI3P10071 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI3P10071 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI3P10071 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI3P10071 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI3P10071 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI3P10071 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI3P10071 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI3P10071 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI3P10071 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI3P10071 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI3P10071 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI3P10071 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI3P10071 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI3P10071 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI3P10071 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GLI3P10071 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI3P10071 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI3P10071 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI3P10071 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI3P10071 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI3P10071 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI3P10071 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI3P10071 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI3P10071 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI3P10071 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI3P10071 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI3P10071 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI3P10071 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI3P10071 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI3P10071 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI3P10071 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI3P10071 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI3P10071 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI3P10071 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI3P10071 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI3P10071 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI3P10071 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GLI3P10071 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI3P10071 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI3P10071 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI3P10071 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI3P10071 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI3P10071 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI3P10071 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI3P10071 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI3P10071 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GLI3P10071 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms