Protein–RNA interactions for Protein: O96019

ACTL6A, Actin-like protein 6A, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6AO96019 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACTL6AO96019 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms