Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNX4O95219 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms