Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPLO60437 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPLO60437 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPLO60437 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPLO60437 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPLO60437 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PPLO60437 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPLO60437 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPLO60437 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPLO60437 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPLO60437 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPLO60437 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPLO60437 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPLO60437 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PPLO60437 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPLO60437 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPLO60437 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PPLO60437 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPLO60437 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPLO60437 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPLO60437 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPLO60437 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PPLO60437 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPLO60437 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPLO60437 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPLO60437 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPLO60437 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPLO60437 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPLO60437 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPLO60437 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPLO60437 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPLO60437 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPLO60437 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PPLO60437 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPLO60437 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPLO60437 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPLO60437 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPLO60437 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPLO60437 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPLO60437 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPLO60437 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPLO60437 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPLO60437 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPLO60437 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPLO60437 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPLO60437 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPLO60437 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PPLO60437 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPLO60437 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPLO60437 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPLO60437 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPLO60437 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PPLO60437 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPLO60437 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPLO60437 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPLO60437 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPLO60437 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPLO60437 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPLO60437 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PPLO60437 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PPLO60437 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPLO60437 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPLO60437 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPLO60437 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPLO60437 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPLO60437 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PPLO60437 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PPLO60437 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms