Protein–RNA interactions for Protein: O43307

ARHGEF9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF9O43307 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARHGEF9O43307 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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