Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms