Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HHLA1C9JL84 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HHLA1C9JL84 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HHLA1C9JL84 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA1C9JL84 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA1C9JL84 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA1C9JL84 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA1C9JL84 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA1C9JL84 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA1C9JL84 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA1C9JL84 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA1C9JL84 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA1C9JL84 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA1C9JL84 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA1C9JL84 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA1C9JL84 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA1C9JL84 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA1C9JL84 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA1C9JL84 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA1C9JL84 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA1C9JL84 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA1C9JL84 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA1C9JL84 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA1C9JL84 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HHLA1C9JL84 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms