Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HMGB1P1B2RPK0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms