Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A8MVJ9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
A8MVJ9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms