Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SETD1BQ9UPS6 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD1BQ9UPS6 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms