Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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USP18Q9UMW8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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USP18Q9UMW8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP18Q9UMW8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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