Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATPIF1Q9UII2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms