Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCMF1Q9P0J7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms