Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VAT1Q99536 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.1 ms